在一項(xiàng)新的研究中,中國(guó)科學(xué)院上海生化與細(xì)胞生物學(xué)研究所的徐國(guó)良(Guo-Liang Xu)課題組、復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的唐惠儒(Huiru Tang)課題組和中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所的黃開耀(Kaiyao Huang)課題組發(fā)現(xiàn)萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)含有一種5mC修飾酶(CMD1),它是TET同源物并通過(guò)碳-碳鍵催化甘油基結(jié)合到5mC的甲基基團(tuán)上,從而導(dǎo)致兩種立體異構(gòu)的堿基產(chǎn)物產(chǎn)生。CMD1的催化活性需要Fe(II)及其結(jié)合基序His-X-Asp的完整性,這種結(jié)合基序在鐵依賴性雙加氧酶中是保守的。相關(guān)研究結(jié)果于2019年5月1日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue”。
然而,與之前描述的使用2-氧戊二酸作為共底物(co-substrate)的TET酶不同的是,CMD1使用L-抗壞血酸(即維生素C)作為必需的共底物。維生素C將它的甘油基部分提供給5mC,同時(shí)伴隨著乙醛酸和二氧化碳的形成。這種源自維生素C的DNA修飾存在于野生型萊茵衣藻的基因組中,但是在CMD1突變?nèi)R茵衣藻的基因組中以低得多的水平存在著。CMD1突變細(xì)胞在暴露于高光水平下的適應(yīng)性也降低了。
LHCSR3是一個(gè)在高光條件下保護(hù)萊茵衣藻免受光氧化損傷的關(guān)鍵基因。與野生型細(xì)胞相比,它在CMD1突變細(xì)胞中高度甲基化和下調(diào),從而導(dǎo)致光保護(hù)性的非光化學(xué)猝滅能力下降。
因此,這項(xiàng)新的研究鑒定出真核生物中的一種新的DNA堿基修飾,這種修飾是由一種不同的TET同源物催化,并且令人意外地源自于維生素C。此外,它還描述了這種DNA堿基修飾可起著一種潛在的表觀遺傳標(biāo)記的作用,因而可能在調(diào)節(jié)光合作用中抵消DNA甲基化。