整合基因組學識別黑人NEPTUNE受試者中與APOL1風險基因型的新關聯(英文)
發(fā)布時間:2019-03-11 15:19:15 瀏覽量: 456
關鍵字:基因組學,黑人,NEPTUNE受試者,APOL1風險,基因型,新關聯
簡介: 摘要
APOL1變體與黑人的腎表型有關。為了改善臨床結果并發(fā)現APOL1相關腎損傷的機制,我們分析了來自腎病綜合癥研究網絡(NEPTUNE)中90名黑人受試者的臨床和基因組數據集,按APOL1風險基因型分層。 90例蛋白尿≥0.5g/ d的受試者參加了原發(fā)性腎病綜合征的第一次活檢并隨訪。確定了臨床結果,并進行了腎臟組織形態(tài)學測量和孟德爾腎病綜合征基因測序.APOL1變異基因型,腎小球和腎小管間質分析來自方案腎活檢核心的轉錄物的差異和相關基因表達。在隱性模型(由兩個風險等位基因定義的高風險基因型)下進行分析。 APOL1高風險基因型與每1.73平方米低eGFR 17 ml / min顯著相關,并且在任何時間完全緩解的概率降低69%,與組織學診斷無關。 APOL1風險組都沒有為孟德爾突變而富集。在腎活檢中,高風險基因型與增加的分數間質區(qū)域,間質纖維化和腎小管萎縮相關。風險基因型與腎內APOL1 mRNA表達水平無關。差異表達分析表明,與高風險基因型(腎小球中的CXCL9,CXCL11和UBD;腎小管間質中的SNOR14B和MUC13)相關的5個基因的穩(wěn)態(tài)水平增加.APOL1管腸炎細胞間共表達分析顯示共表達APOL1mRNA水平與一組腎內轉錄物一起與間質纖維化和腎小管萎縮增加有關。這些數據表明,高風險的APOL1基因型在組織病理學診斷中具有腎臟風險。