關(guān)鍵字：遺傳學，查詢病例組，單基因腎病綜合征，診斷

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簡介： 摘要
為了最大化腎病綜合征（NS）患者的遺傳篩查診斷單基因原因的臨床益處，可靠地區(qū)分NS引起的變異與所有基因組中普遍存在的罕見，非因果變異的背景是至關(guān)重要的。為了確定北美病例隊列中單基因NS的患病率，同時考慮遺傳變異的背景流行，我們對來自腎病綜合征研究網(wǎng)絡(luò)的312名參與者和來自1000基因組計劃（1000G）的61名參與對照的21個牽連單基因NS基因進行了測序。這些分析擴展到來自1000G的約2500名受試者的可用序列數(shù)據(jù)。典型的致病性過濾器確定了4.2％的患者和來自1000G的5.8％的受試者的NS的因果變異。我們設(shè)計了一種更嚴格的致病性過濾策略，將因果變異的背景患病率降低至1.5％。當將這種嚴格的過濾器應用于患者時，單基因NS的患病率為2.9％;在這些患者中，67％是兒科，44％有FSGS進行活檢。完全緩解率與單基因分類無關(guān)。因此，我們確定了導致NS不準確的單基因分類的因素，并制定了更準確的變異過濾策略。在該偶發(fā)性受影響的群組中，單基因NS的患病率和臨床相關(guān)性與針對遺傳分析的患者的報告顯著不同。特別是在未選擇的基于人群的病例中，從概率而非確定性的角度考慮已知NS基因的假定因果變異可能更精確。我們還介紹了GeneVetter，一種用于罕見疾病單基因評估的網(wǎng)絡(luò)工具。